하. 별로 그런 문제는 생각하지 않았는데..
우선 첫번째 문제는...
popup.html  파일을 열어서..

if ($data[pop_level] > $member[mb_level]) alert_close('해당 레벨은 볼수 없어요~');
을 추가 해주면 됩니다.

두번째 문제는... 조금 어렵습니다. 레벨에 따라서 구분을 해줘야 하는데.
템플릿정도 이용하면 될것 같습니다.
다만 팝업을 html이나 text를 쓰지 않고 WYSIWYG 에디터를 씁니다. 프로그램이나 html을 모르는 분들을 위해 쉽게 쓸수 있기 때문에 WYSIWYG을 쓰는거죠.
님이 원하시는것은 WYSIWYG을 쓸수 없습니다. WYSIWYG을 써도 되긴하지만 여러가지 문제가 생김니다.

간단히 응용하시려면..
$data[pop_contents] = preg_replace_callback('@\\[LEVEL([^\\]]*)\\](.*)\\[/LEVEL\\]@Usi', 'level_pass', $data[pop_contents]);
function level_pass($matche)
{
global $member;
if (strlen($matche[1]) == 0) {
$text .= $matche[2]; // 혹시 레벨을 지정하지 않는 실수를 할까봐....
} else {
if ($member[mb_level] >= $matche[1]) $text .= $matche[2];
}
return $text;
}

예를들어 "레벨 4이상만 보입니다. [LEVEL 4]레벨4내용[/LEVEL]<br /> 레벨 2이상만 보입니다. [LEVEL 2]레벨2내용[/LEVEL] " 이런식의 내용이 입력 되었다면 레벨 2의 멤버는..

레벨 4이상만 보입니다.
레벨 2이상만 보입니다. 레벨2내용

이런식으로 보입니다. 지정레벨 이상만 내용을 볼수 있다는 거죠..

popup.html

<?
include_once("./_common.php");

include_once("$g4[path]/MintUtil/MintLib.php");

if(isDbTable($Mint[DB_popup]) != 1) {
alert_close($Mint[name].'(POPUP) DB가 생성되지 않았습니다.');
}

$sql = "select * from $Mint[DB_popup] where pop_id='$pop_id' ";
$sel = mysql_query($sql);
$data = mysql_fetch_array($sel);

$cookie_id = "popup_".$data[pop_id];

$data[pop_contents] = preg_replace_callback('@\\[LEVEL([^\\]]*)\\](.*)\\[/LEVEL\\]@Usi', 'level_pass', $data[pop_contents]);
function level_pass($matche)
{
global $member;
if (strlen($matche[1]) == 0) {
$text .= $matche[2]; // 혹시 레벨을 지정하지 않는 실수를 할까봐....
} else {
if ($member[mb_level] >= $matche[1]) $text .= $matche[2];
}
return $text;
}

if ($data[pop_level] > $member[mb_level]) alert_close('해당 레벨은 볼수 없어요~');
?>

이렇게 넣고 테스트했더니 말씀해주신것처럼 해결이 되었습니다^^ 감사합니다.